黄初七年，魏文帝病逝，薛灵芸也不知下落。令人不解的是魏文帝的两个有名的妃子都与“神仙”有关，甄妃是“洛神”，薛灵芸是“针神”。
薛灵芸的故事在正史里没有记载，许多野史笔记偶尔提及，如《拾遗记》、《太平广记》、《艳异编》等。李商隐有“一夜芙蓉红泪多”;贺铸《石州引》有“画楼芳酒，红泪清歌，顿成轻别。已是经年，杳杳音尘多绝。欲知方寸，共有几许清愁?”其中“红泪”即是薛灵芸的典故。《拾遗记》中说，薛灵芸离别父母登车上路之时，用玉唾壶承泪，壶呈红色。及至京师，壶中泪凝如血。后世因而称女子的眼泪为“红泪”。后来成了一个通用的典故，如红蜡烛垂的是“红泪”，子规鸟哀啼泣血等。据说唐代杨玉环被召入宫前，“泣涕登车，时方寒，泪结为红冰”。
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清代冒鹤亭《太清遗事诗》云：“太平湖畔太平街，南谷春深葬夜来。人是倾城姓倾国，丁香花发一低徊。”其中“夜来”亦指薛灵芸。《红楼梦》第六十四回叙众人玩象牙筹：“黛玉宝钗取出几根来看，一面刻的是古来美人，一面是词句并各种饮例。大家都说有趣，当下说定由宝钗起令。宝钗抽了一根，刻的美人是薛灵芸，那面词句是‘问何因玉筋惹春红’，注‘善啼者饮，浓妆者饮’。笑道：‘这善啼的，除了林妹妹还有谁?’”大概薛灵芸之善哭只有林黛玉可以比拟一二。
估计薛灵芸神秘莫测的事迹纯属历史虚构，但作为一种精神的意象，她比真实的存在更加深入人心。
