据档案资料显示，100部队利用老鼠进行细菌战的各项实验，用狗培植狂犬病菌，用马研究炭疽和鼻疽，用牛羊猪分别制造牛瘟、羊瘟和猪瘟，用鸽子进行病菌传染……然后疯狂地将这些病菌投放到无辜的居民区，对受害地区人民的生命财产造成了无法估量的伤害和损失。
原关东军司令部兽医处长高桥隆笃曾向梅津美治郎司令官汇报了100部队的生产能力：“第100部队在一年内能制造的细菌数量是：炭疽热细菌1000公斤，鼻疽细菌500公斤，锈菌100公斤。”
一位长期从事100部队相关研究的专家透露，100部队的研究人员为了达到实验目的，除了在基地内进行实验外，还故意将一些受到细菌感染的动物赶往附近村庄和牧场，导致百姓的大批牲畜死亡。
据记载，1942年，100部队的军官和研究人员曾将12公斤鼻疽菌全部倒入中苏边境的德尔布尔河，以此作为演习的实验项目，造成了大量人畜死亡。
对动物的研究仅仅是其罪恶行径的“表面文章”。学者的研究证据表明，与731部队一样，100部队中也曾进行过大量人体实验。
据介绍，长春当地农民曾经把100部队附近填埋场里的动物骨头作为肥料，一些农民在挖取时意外地挖到了人骨，并且越挖越多，一个巨大的尸体填埋坑就此被发现。当地农民形容，这个尸体填埋场是“一里来地的长条”，“挖到六尺到一丈深还有人的尸体”。
据长春伪满皇宫博物院提供的资料显示，100部队的魔爪曾经伸向了大连、海拉尔、拉古、密山、鸡西等地，在多地建立了支队，侧重研究野外大量使用各种细菌，并验证大规模杀害牲畜和人的方法及其效果。据记载，当时100部队的实验范围，近至长春及周边地区，西至西安等城市，北至满洲里、内蒙古一代及西伯利亚地区；南至广东一带。
专家表示，由于目前关于100部队的研究资料较少，到底他们的罪恶行径害死了多少人，目前没有准确的说法，但可以推测的是，被残害人数将是一个惊人的数字。
