后来窦太后死了，刘肇也长大，开始亲政。一句话说，一朝天子一朝臣，换一个主子，蔡公公的辉煌日子该过去了吧?N0，蔡公公又被新主子看中了。
刘肇的皇后邓绥是位绝色佳人，也是一位博学才女，才女与才子总是惺惺相惜，邓皇后很欣赏这位蔡公公，蔡公公也乐于为新主子效劳。
换了主子，蔡公公仍然红得发紫。
这期间他出任尚方令。尚方令主管御用器物的制作，蔡公公上任以后，改新技术，皇家御用作坊的制作技艺有了飞跃式发展。史书上说他“监作秘剑及诸器械，莫不精工坚密，为后世法”。当然了，他做的对后世影响最大的一件事是——改进了造纸术。
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造纸术西汉已经出现，但是原料贵，产量低，质量差，无法广泛应用。蔡公公是个有心人，他在乡间见蚕妇缫丝漂絮后，竹簟上留下一层丝絮，揭下来可以用来书写，从而得到启发，他让人们收集树皮、废麻、破布、旧鱼网等原料，用锉、煮、浸、捣、抄等法，重复实验，终于造出价钱低廉的新式纸。他将造纸过程写成奏章，连同造出来的纸呈报给刘肇，刘肇对蔡公公的技术大大称赞，蔡公公的造纸术传开，人们把这种纸称为“蔡侯纸”。
