南明亡于内耗:连皇帝都无人供奉而活活饿死

顺治六年(1649年)正月，朱以海只好移驻福建和浙江两省交界的沙埕，几个月后，张名振攻取健跳所，将朱以海迎到健跳所居住。这段时间，权臣郑彩同郑成功发生火并，被郑成功击败，不得已上表求救，朱以海对他断送大明中兴的大好时机极为痛恨，乘机收编郑彩余部。

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立足舟山“隆中对”中的第一步收复福建未能成功，张名振修正了计划，他建议朱以海收取被黄斌卿割据的舟山群岛，再连结日本、朝鲜等国，渐图恢复。此刻，朱以海驻跸于健跳所，健跳所只是浙江临海县一个濒海的小地方，难以立足，朱以海和他的大臣们实际上常常住在船上，以防清军来袭。顺治六年(1649年)九月，张名振派兵袭杀黄斌卿，管了黄斌卿军。朱以海到达舟山后，下令礼葬黄斌卿，恩养他的家属，对黄斌卿旧部加以安抚，并且给予赏赐。舟山群岛局势得到稳定，朱以海奋战数年，终于有了一个复兴基地。