所以，辩护律师们采取的方式是，放弃对日军暴行的辩护，而把重点放在作为方面军最高指挥官的松井石根大将应不应该为部下的行为负责、以及负责到何种程度。
最后，松井石根被东京军事法庭判处了死刑。
东京审判后，有30万受害者的南京大屠杀成了定论
但应该指出，当年中国政府在日本辩护律师放弃辩护努力之际，并没有努力立证，而是敷衍了事。本身，中国政府仅仅把东京审判看成复仇手段，而没有像苏联政府那样，把东京军事法庭作为讲坛，将日本帝国对苏联的所作所为都进行详细论述。(正因如此，到现在为止，日本右翼始终没有人为从出兵西伯利亚到“9·18”事变这段历史翻案的原因，因为苏联人在这段历史上得到了日本当事人的口供，做成了铁案。)而中国政府在这方面的工作则令人遗憾。
参加南京大屠杀的第十六师团，后来在莱特战役中被美军全歼，13000人仅剩下620人，麦克阿瑟曾请中国政府协助在这些人中寻找有无参加过南京大屠杀的凶手，但没有得到积极回应。
这样的结果，造成东京国际军事法庭最后的判决书有互相矛盾之处。判决书中提到：“据估计，在最初的六个星期内，南京周围被杀害的非战斗人员在20万以上，发生强奸案两万以上。”而对松井石根本人的判决书则说：“数千名妇女被强奸，被杀害的人数在十万以上。”中国政府对这个明显的矛盾没有提出异议，埋下了一个“南京大屠杀人数未定”的祸根。
其实“30万”这个数字在东京军事法庭上并没有正式出现过，“20万”的数字则是采信自许传音博士在法庭证词中的“一般认为在20万左右”的说法。“30万”这个数字，实际上出自南京军事法庭对原第六师团师团长谷寿夫中将的判决书。
南京军事法庭与东京国际军事法庭的审判时间上差不多。东京审判之后，有30万受害者的南京大屠杀也就成了定论，即使在日本也没有人提出质疑，顶多是有人在提到南京大屠杀时说“杀害了好几十万人”。还有人虽然不肯承认30万这个数字，但也都接受了东京审判的结果。
日本社会的主流认知承认发生过南京大屠杀
